Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms