Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GARNL3Q5VVW2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms