Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms