Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms