Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms