Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms