Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms