Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms