Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ANKRD39Q53RE8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ANKRD39Q53RE8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms