Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms