Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms