Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms