Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms