Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms