Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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