Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NFE2Q16621 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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