Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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RPE65Q16518 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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RPE65Q16518 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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RPE65Q16518 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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RPE65Q16518 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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RPE65Q16518 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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RPE65Q16518 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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