Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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