Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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