Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms