Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
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