Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCINQ13939 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCINQ13939 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCINQ13939 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCINQ13939 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCINQ13939 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCINQ13939 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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