Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOFQ13790 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOFQ13790 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOFQ13790 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms