Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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