Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CAMK2BQ13554 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms