Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms