Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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