Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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