Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 FUS1YCL027W 1539 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 APC2YLR127C 2562 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 TRM2YKR056W 1920 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YDL009CYDL009C 324 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 CHZ1YER030W 462 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YIL029CYIL029C 429 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 PAU23YLR037C 375 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 SMA2YML066C 1110 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YOR364WYOR364W 369 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 SIP3YNL257C 3690 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 COG3YER157W 2406 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 REV3YPL167C 4515 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 SPB1YCL054W 2526 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 ERP6YGL002W 651 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YGL042CYGL042C 306 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 ILM1YJR118C 612 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YJR141WYJR141W 1044 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YNL179CYNL179C 438 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 PEX17YNL214W 600 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YOL150CYOL150C 312 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 ACM1YPL267W 630 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 BCK1YJL095W 4437 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 SAS2YMR127C 1017 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YNR021WYNR021W 1215 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 ESF2YNR054C 951 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 OST2YOR103C 393 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YPR050CYPR050C 414 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 RTS3YGR161C 792 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 GIC1YHR061C 945 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 DFG10YIL049W 762 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YIR020CYIR020C 303 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 HRI1YLR301W 735 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 UBX4YMR067C 1251 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 RIO2YNL207W 1278 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 PEP12YOR036W 867 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YPL034WYPL034W 498 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 RLI1YDR091C 1827 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YOL098CYOL098C 3114 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 SNF12YNR023W 1701 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 NPR1YNL183C 2373 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 TOP2YNL088W 4287 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 TIF35YDR429C 825 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 PRE1YER012W 597 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 BET4YJL031C 984 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YLR302CYLR302C 363 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 RPS1AYLR441C 768 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 COQ10YOL008W 624 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YPL068CYPL068C 882 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 VPS13YLL040C 9435 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 ARP8YOR141C 2646 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 TRA1YHR099W 11235 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 TCB2YNL087W 3537 nt2.65□□□□□ -1.98
SEC39Q12745 YPK1YKL126W 2043 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 PRM8YGL053W 714 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 NOP19YGR251W 591 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 BET3YKR068C 582 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YLR252WYLR252W 306 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YPR096CYPR096C 303 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 POM152YMR129W 4014 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 DNL4YOR005C 2835 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 NAB3YPL190C 2409 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SSF1YHR066W 1362 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 NEW1YPL226W 3591 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YHR078WYHR078W 1659 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 RLF2YPR018W 1821 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 OTU2YHL013C 924 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 FYV4YHR059W 393 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 HHT2YNL031C 411 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YPL276WYPL276W 438 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SNX41YDR425W 1878 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 PUF4YGL014W 2667 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 NPR3YHL023C 3441 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 FKS3YMR306W 5358 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 UBP16YPL072W 1500 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 GDI1YER136W 1356 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SVL3YPL032C 2478 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 IST3YIR005W 447 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YLR202CYLR202C 327 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 JIP3YLR331C 378 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 BER1YLR412W 825 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 ARR2YPR200C 393 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 PDR3YBL005W 2931 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SMY2YBR172C 2223 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 GIN4YDR507C 3429 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SIR3YLR442C 2937 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 GCV2YMR189W 3105 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 TRS130YMR218C 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YGL015CYGL015C 393 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 TMA10YLR327C 261 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 CCW14YLR390W-A 717 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YML037CYML037C 1023 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SWM2YNR004W 441 nt2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms