Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms