Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms