Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms