Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 TOF2YKR010C 2316 nt4.66□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 UBP5YER144C 2418 nt4.65□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 NUP60YAR002W 1620 nt4.65□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 HUL4YJR036C 2679 nt4.65□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 SRB4YER022W 2064 nt4.65□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 RPS0AYGR214W 759 nt4.65□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YOR376WYOR376W 369 nt4.65□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 MNT3YIL014W 1893 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 DNF2YDR093W 4839 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 PFK26YIL107C 2484 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YDR426CYDR426C 378 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YFR035CYFR035C 345 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YLR012CYLR012C 300 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 TAF5YBR198C 2397 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 SEC39YLR440C 2130 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 APL6YGR261C 2430 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 KGD1YIL125W 3045 nt4.64□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 HIR2YOR038C 2628 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 SSE1YPL106C 2082 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 PSE1YMR308C 3270 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 MBP1YDL056W 2502 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 SBH1YER087C-B 249 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 FMP32YFL046W 624 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YHL005CYHL005C 393 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 OAF3YKR064W 2592 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YGR250CYGR250C 2346 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 KIN4YOR233W 2403 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 CRT10YOL063C 2874 nt4.63□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 SSH1YBR283C 1473 nt4.62□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YTA6YPL074W 2265 nt4.62□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 CSE2YNR010W 450 nt4.62□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 KEX1YGL203C 2190 nt4.62□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 EBS1YDR206W 2655 nt4.62□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YBR184WYBR184W 1572 nt4.61□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 TPS2YDR074W 2691 nt4.61□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 VID22YLR373C 2706 nt4.61□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 DAP2YHR028C 2457 nt4.61□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 UBP12YJL197W 3765 nt4.61□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.61□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YNR042WYNR042W 429 nt4.61□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt4.61□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 SWC3YAL011W 1878 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 CAF4YKR036C 1932 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 MNL1YHR204W 2391 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 APC9YLR102C 798 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 NKP2YLR315W 462 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 RPL36AYMR194W 303 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 ALY1YKR021W 2748 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 PEX5YDR244W 1839 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 FAA3YIL009W 2085 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 GLN4YOR168W 2430 nt4.6□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 HBT1YDL223C 3141 nt4.59□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 YOR015WYOR015W 360 nt4.59□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 ISW2YOR304W 3363 nt4.59□□□□□ -1.67
BUD20Q08004 SPI1YER150W 447 nt4.58□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt4.58□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 PAU23YLR037C 375 nt4.58□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 LDS2YOL047C 1071 nt4.58□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt4.58□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 MSS11YMR164C 2277 nt4.58□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 AKL1YBR059C 3327 nt4.58□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 CYM1YDR430C 2970 nt4.58□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 AVT1YJR001W 1809 nt4.58□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 MNR2YKL064W 2910 nt4.57□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 SNA2YDR525W-A 240 nt4.57□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.57□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 CCW14YLR390W-A 717 nt4.57□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 DPH6YLR143W 2058 nt4.57□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 SAP4YGL229C 2457 nt4.56□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 CDC45YLR103C 1953 nt4.56□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 PAN1YIR006C 4443 nt4.56□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 ASK10YGR097W 3441 nt4.56□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt4.56□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 HHF1YBR009C 312 nt4.56□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 YER077CYER077C 2067 nt4.56□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 NNK1YKL171W 2787 nt4.56□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 VIP1YLR410W 3441 nt4.56□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 CWH41YGL027C 2502 nt4.55□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 RDH54YBR073W 2877 nt4.55□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 TUP1YCR084C 2142 nt4.55□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 PRP43YGL120C 2304 nt4.55□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 YLR346CYLR346C 306 nt4.55□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 SEC5YDR166C 2916 nt4.55□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 JHD2YJR119C 2187 nt4.54□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 NPC2YDL046W 522 nt4.54□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 PMP2YEL017C-A 132 nt4.54□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 COA3YJL062W-A 258 nt4.54□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt4.54□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 SAR1YPL218W 573 nt4.54□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 SWA2YDR320C 2007 nt4.54□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 TRM44YPL030W 1704 nt4.54□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 PDR15YDR406W 4590 nt4.53□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 PGM2YMR105C 1710 nt4.53□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 SSY1YDR160W 2559 nt4.53□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 RPS29BYDL061C 171 nt4.53□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 SAE3YHR079C-A 276 nt4.53□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 SRL3YKR091W 741 nt4.53□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 PHM7YOL084W 2976 nt4.53□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 ISU1YPL135W 498 nt4.53□□□□□ -1.68
BUD20Q08004 PDE2YOR360C 1581 nt4.53□□□□□ -1.69
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