Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms