Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms