Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKCDQ05655 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms