Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4A11Q02928 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms