Protein–RNA interactions for Protein: Q00723

PRP38, Pre-mRNA-splicing factor 38, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP38Q00723 YOL057WYOL057W 2136 nt2.3□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 YEF3YLR249W 3135 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 VTC3YPL019C 2508 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 OSW7YFR039C 1533 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 snR59snR59 78 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 APC11YDL008W 498 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 OTU2YHL013C 924 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 ACF4YJR083C 930 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 RPS1AYLR441C 768 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 GMC2YLR445W 567 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 ATP18YML081C-A 180 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 RRG8YPR116W 834 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 UBP15YMR304W 3693 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 TMN3YER113C 2121 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 SMC6YLR383W 3345 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 CTF13YMR094W 1437 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 YDR029WYDR029W 315 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 SLX9YGR081C 633 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 PAU23YLR037C 375 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 CSI1YMR025W 888 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 ALG14YBR070C 714 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP38Q00723 SEN54YPL083C 1404 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YRR1YOR162C 2433 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 SHE4YOR035C 2370 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 ERG28YER044C 447 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 EMC4YGL231C 573 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 PEX4YGR133W 552 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YGR228WYGR228W 345 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 BUD19YJL188C 309 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YAL037WYAL037W 804 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YOR169CYOR169C 465 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 ATP3YBR039W 936 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 snR191snR191 274 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 TRS130YMR218C 3309 nt2.26□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 GAL80YML051W 1308 nt2.26□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 SWA2YDR320C 2007 nt2.26□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 GCD10YNL062C 1437 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 BFR1YOR198C 1413 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YBT1YLL048C 4986 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 SCP160YJL080C 3669 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 SNX41YDR425W 1878 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 MRP10YDL045W-A 288 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 TIM11YDR322C-A 291 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YDR537CYDR537C 606 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YGR242WYGR242W 309 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 PAU14YIL176C 363 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 PAU1YJL223C 363 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 CSE4YKL049C 690 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 MRP49YKL167C 414 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 RBL2YOR265W 321 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 Q0017Q0017 162 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YOL098CYOL098C 3114 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 TRZ1YKR079C 2517 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 GET1YGL020C 708 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 SCEIQ0160 708 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 LRP1YHR081W 555 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 TMA10YLR327C 261 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 RPL25YOL127W 429 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 ARF3YOR094W 552 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YOR283WYOR283W 693 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 LOA1YPR139C 903 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 EDS1YBR033W 2760 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 AFR1YDR085C 1863 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 DNF1YER166W 4716 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 TRM2YKR056W 1920 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 MES1YGR264C 2256 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YDL187CYDL187C 330 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 VPS74YDR372C 1038 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 RPS26BYER131W 360 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 ERV1YGR029W 570 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 TAP42YMR028W 1101 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YMR187CYMR187C 1296 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 COQ10YOL008W 624 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YPR172WYPR172W 603 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 SPB1YCL054W 2526 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 SSD1YDR293C 3753 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 RLP24YLR009W 600 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 YMR144WYMR144W 1029 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 STH1YIL126W 4080 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 POM152YMR129W 4014 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 BNI1YNL271C 5862 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP38Q00723 AMS1YGL156W 3252 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP38Q00723 YFH1YDL120W 525 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP38Q00723 YRB1YDR002W 606 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP38Q00723 IRC2YDR112W 309 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP38Q00723 PEA2YER149C 1263 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP38Q00723 YMR31YFR049W 372 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP38Q00723 AYR1YIL124W 894 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP38Q00723 PSY1YKL076C 384 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP38Q00723 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP38Q00723 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.21□□□□□ -2.06
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