Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms