Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms