Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS9P82933 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPS9P82933 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms