Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms