Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VBP1P61758 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VBP1P61758 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VBP1P61758 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VBP1P61758 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VBP1P61758 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms