Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms