Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms