Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHBP55084 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHBP55084 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHBP55084 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHBP55084 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHBP55084 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHBP55084 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHBP55084 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHBP55084 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHBP55084 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHBP55084 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHBP55084 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HADHBP55084 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HADHBP55084 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHBP55084 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHBP55084 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHBP55084 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHBP55084 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHBP55084 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHBP55084 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHBP55084 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHBP55084 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHBP55084 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms