Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC4P55056 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC4P55056 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC4P55056 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC4P55056 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC4P55056 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC4P55056 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC4P55056 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC4P55056 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC4P55056 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC4P55056 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC4P55056 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC4P55056 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC4P55056 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC4P55056 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC4P55056 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC4P55056 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC4P55056 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC4P55056 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC4P55056 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC4P55056 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC4P55056 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC4P55056 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC4P55056 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOC4P55056 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC4P55056 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC4P55056 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC4P55056 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms