Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms