Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBX1P52954 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBX1P52954 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBX1P52954 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBX1P52954 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBX1P52954 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBX1P52954 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBX1P52954 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBX1P52954 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LBX1P52954 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LBX1P52954 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LBX1P52954 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LBX1P52954 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LBX1P52954 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LBX1P52954 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LBX1P52954 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LBX1P52954 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms