Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGS4P49798 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGS4P49798 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGS4P49798 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGS4P49798 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS4P49798 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS4P49798 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS4P49798 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS4P49798 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms